Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RPRD1AQ96P16 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms