Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SH3KBP1Q96B97 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SH3KBP1Q96B97 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms