Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBXN4Q92575 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms