Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDXQ7Z353 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms