Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYS1Q717R9 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYS1Q717R9 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYS1Q717R9 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYS1Q717R9 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYS1Q717R9 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYS1Q717R9 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYS1Q717R9 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYS1Q717R9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYS1Q717R9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYS1Q717R9 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CYS1Q717R9 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYS1Q717R9 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYS1Q717R9 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYS1Q717R9 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYS1Q717R9 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYS1Q717R9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYS1Q717R9 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYS1Q717R9 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYS1Q717R9 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYS1Q717R9 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYS1Q717R9 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYS1Q717R9 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYS1Q717R9 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYS1Q717R9 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CYS1Q717R9 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CYS1Q717R9 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CYS1Q717R9 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CYS1Q717R9 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms