Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CCBE1Q6UXH8 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CCBE1Q6UXH8 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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