Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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MED27Q6P2C8 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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MED27Q6P2C8 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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MED27Q6P2C8 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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MED27Q6P2C8 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MED27Q6P2C8 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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