Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
ANKRD54Q6NXT1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ANKRD54Q6NXT1 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms