Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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WSCD1Q658N2 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WSCD1Q658N2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms