Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
STRIP1Q5VSL9 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms