Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D3Q587I9 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms