Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SARDH-207ENST00000439388 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FCGR3A-206ENST00000443193 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJB5-210ENST00000545841 3068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AP001150.1-201ENST00000558822 2128 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PARP6-223ENST00000616176 2102 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CLK3-201ENST00000345005 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CICP18-201ENST00000406017 2812 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RTN3-203ENST00000341307 2524 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms