Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP7Q16576 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP7Q16576 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP7Q16576 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP7Q16576 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP7Q16576 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP7Q16576 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP7Q16576 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP7Q16576 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP7Q16576 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP7Q16576 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP7Q16576 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP7Q16576 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP7Q16576 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP7Q16576 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP7Q16576 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP7Q16576 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP7Q16576 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RBBP7Q16576 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP7Q16576 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP7Q16576 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP7Q16576 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RBBP7Q16576 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP7Q16576 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP7Q16576 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP7Q16576 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP7Q16576 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP7Q16576 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP7Q16576 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RBBP7Q16576 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP7Q16576 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RBBP7Q16576 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP7Q16576 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP7Q16576 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RBBP7Q16576 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP7Q16576 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP7Q16576 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP7Q16576 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP7Q16576 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP7Q16576 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP7Q16576 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP7Q16576 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP7Q16576 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP7Q16576 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP7Q16576 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP7Q16576 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP7Q16576 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP7Q16576 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RBBP7Q16576 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP7Q16576 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP7Q16576 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP7Q16576 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP7Q16576 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP7Q16576 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms