Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RPE65Q16518 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RPE65Q16518 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RPE65Q16518 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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RPE65Q16518 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPE65Q16518 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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