Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GABRA6Q16445 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms