Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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ZNF56Q15929 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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ZNF56Q15929 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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ZNF56Q15929 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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ZNF56Q15929 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ZNF56Q15929 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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ZNF56Q15929 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
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ZNF56Q15929 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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ZNF56Q15929 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
ZNF56Q15929 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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