Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ZFHX3Q15911 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms