Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TAF1AQ15573 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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