Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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LAPTM4AQ15012 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 RNF139-AS1-202ENST00000519861 359 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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LAPTM4AQ15012 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
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LAPTM4AQ15012 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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LAPTM4AQ15012 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 AC092809.4-201ENST00000420350 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
LAPTM4AQ15012 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
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