Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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SEMA3AQ14563 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SEMA3AQ14563 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SEMA3AQ14563 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SEMA3AQ14563 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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SEMA3AQ14563 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SEMA3AQ14563 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SEMA3AQ14563 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SEMA3AQ14563 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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SEMA3AQ14563 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SEMA3AQ14563 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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SEMA3AQ14563 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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SEMA3AQ14563 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SEMA3AQ14563 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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SEMA3AQ14563 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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