Protein–RNA interactions for Protein: Q13642

FHL1, Four and a half LIM domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL1Q13642 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FHL1Q13642 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms