Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HDAC1Q13547 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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