Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
ATRQ13535 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
ATRQ13535 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
ATRQ13535 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ATRQ13535 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ATRQ13535 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ATRQ13535 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ATRQ13535 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ATRQ13535 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ATRQ13535 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
ATRQ13535 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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