Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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PRKAA1Q13131 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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PRKAA1Q13131 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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PRKAA1Q13131 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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PRKAA1Q13131 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRKAA1Q13131 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRKAA1Q13131 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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