Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RLFQ13129 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RLFQ13129 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RLFQ13129 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RLFQ13129 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RLFQ13129 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RLFQ13129 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RLFQ13129 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RLFQ13129 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RLFQ13129 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RLFQ13129 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RLFQ13129 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RLFQ13129 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RLFQ13129 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RLFQ13129 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RLFQ13129 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RLFQ13129 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RLFQ13129 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RLFQ13129 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RLFQ13129 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RLFQ13129 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RLFQ13129 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RLFQ13129 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RLFQ13129 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RLFQ13129 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RLFQ13129 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RLFQ13129 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RLFQ13129 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RLFQ13129 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RLFQ13129 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLFQ13129 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLFQ13129 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLFQ13129 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLFQ13129 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLFQ13129 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLFQ13129 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLFQ13129 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLFQ13129 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLFQ13129 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLFQ13129 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLFQ13129 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLFQ13129 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLFQ13129 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLFQ13129 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLFQ13129 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLFQ13129 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLFQ13129 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RLFQ13129 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RLFQ13129 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLFQ13129 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLFQ13129 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLFQ13129 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLFQ13129 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLFQ13129 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RLFQ13129 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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