Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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FOXF1Q12946 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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FOXF1Q12946 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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FOXF1Q12946 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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FOXF1Q12946 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
FOXF1Q12946 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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