Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNH2Q12809 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms