Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms