Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HDAC4P56524 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms