Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDST1P52848 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDST1P52848 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDST1P52848 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDST1P52848 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDST1P52848 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDST1P52848 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDST1P52848 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDST1P52848 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDST1P52848 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDST1P52848 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDST1P52848 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDST1P52848 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NDST1P52848 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDST1P52848 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDST1P52848 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDST1P52848 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDST1P52848 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDST1P52848 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDST1P52848 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NDST1P52848 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDST1P52848 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDST1P52848 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NDST1P52848 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NDST1P52848 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NDST1P52848 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NDST1P52848 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms