Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF143P52747 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF143P52747 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms