Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA4P43681 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms