Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXD12P35452 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms