Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RBL1P28749 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RBL1P28749 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBL1P28749 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBL1P28749 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBL1P28749 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBL1P28749 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBL1P28749 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBL1P28749 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBL1P28749 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBL1P28749 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBL1P28749 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBL1P28749 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RBL1P28749 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms