Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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CXCL3P19876 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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CXCL3P19876 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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CXCL3P19876 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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CXCL3P19876 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
CXCL3P19876 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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