Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NFKB1P19838 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms