Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LIG1P18858 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LIG1P18858 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LIG1P18858 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LIG1P18858 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LIG1P18858 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LIG1P18858 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LIG1P18858 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LIG1P18858 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LIG1P18858 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LIG1P18858 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LIG1P18858 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LIG1P18858 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LIG1P18858 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LIG1P18858 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LIG1P18858 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LIG1P18858 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LIG1P18858 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LIG1P18858 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LIG1P18858 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LIG1P18858 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LIG1P18858 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LIG1P18858 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LIG1P18858 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LIG1P18858 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LIG1P18858 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LIG1P18858 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LIG1P18858 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LIG1P18858 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms