Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DESP17661 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DESP17661 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DESP17661 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DESP17661 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DESP17661 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DESP17661 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DESP17661 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DESP17661 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DESP17661 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DESP17661 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DESP17661 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
DESP17661 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DESP17661 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DESP17661 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms