Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NEFHP12036 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NEFHP12036 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEFHP12036 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEFHP12036 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEFHP12036 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEFHP12036 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEFHP12036 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEFHP12036 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEFHP12036 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEFHP12036 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEFHP12036 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEFHP12036 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEFHP12036 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEFHP12036 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEFHP12036 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEFHP12036 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEFHP12036 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEFHP12036 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEFHP12036 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEFHP12036 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEFHP12036 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEFHP12036 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NEFHP12036 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEFHP12036 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEFHP12036 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEFHP12036 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEFHP12036 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEFHP12036 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEFHP12036 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEFHP12036 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NEFHP12036 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEFHP12036 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEFHP12036 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NEFHP12036 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEFHP12036 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEFHP12036 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEFHP12036 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEFHP12036 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEFHP12036 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEFHP12036 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEFHP12036 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEFHP12036 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NEFHP12036 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEFHP12036 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEFHP12036 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NEFHP12036 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms