Protein–RNA interactions for Protein: P11487

FGF3, Fibroblast growth factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF3P11487 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FGF3P11487 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FGF3P11487 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FGF3P11487 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FGF3P11487 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms