Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TOP2AP11388 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms