Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TMEM225BP0DP42 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TMEM225BP0DP42 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms