Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IFNB1P01574 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IFNB1P01574 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms