Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PAPLNO95428 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms