Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG7O95352 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG7O95352 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG7O95352 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG7O95352 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG7O95352 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG7O95352 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG7O95352 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG7O95352 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG7O95352 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG7O95352 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG7O95352 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG7O95352 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG7O95352 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG7O95352 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG7O95352 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG7O95352 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATG7O95352 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATG7O95352 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATG7O95352 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms