Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LRATO95237 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LRATO95237 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LRATO95237 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms