Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SKAP2O75563 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms