Protein–RNA interactions for Protein: O43823

AKAP8, A-kinase anchor protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP8O43823 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AKAP8O43823 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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