Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
MCRIP1C9JLW8 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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