Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EFCAB5A4FU69 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms